מוזיאון האקרופוליס של אתונה ממוקם ברחוב היפה דיוניסיו אריאופגיטו, באזור הציורי מקריאני (או שכונת האקרופוליס), במרחק של כ־300 מטר בלבד מהאקרופוליס.

המוזיאון נבנה כדי לאחסן את הממצאים הרבים שהתגלו בחפירות על הסלע הקדוש, מאחר שכמות הממצאים גדלה עד שלא ניתן היה להציגם עוד במוזיאון האקרופוליס הישן, שהיה ממוקם ליד הפרתנון.
בנוסף לממצאים מהאקרופוליס עצמו, מוצגים בו גם פריטים מאתרים ארכאולוגיים נוספים ברחבי חצי האי אטיקה, כמו מקדש ארטמיס בדרום־מזרח אתונה.

המוזיאון תוכנן על ידי האדריכל הניו־יורקי ברנרד טשומי בשיתוף האדריכל היווני מיכאל פוטיאדס.
למרות שהפרויקט נמשך שנים רבות (הדיונים החלו כבר בשנת 1975), המוזיאון נחנך לבסוף ביוני 2009.
עלות הבנייה הסתכמה בכ־130 מיליון אירו, במימון ממשלת יוון והקרן האירופית לפיתוח אזורי.

שטח המבנה הכולל הוא כ־23,000 מ"ר, מתוכם כ־14,000 מ"ר שטחי תצוגה. המוזיאון מחולק לשלוש קומות עיקריות ושני מפלסים ביניים.
מאפיין בולט של המבנה הוא השימוש הנרחב בזכוכית, הן בחלקו הפנימי והן החיצוני.

המוצגים במוזיאון כוללים פריטים מהתקופה הברונזית היוונית, התקופה הרומית והתקופה הביזנטית.